- Лаборатория регуляции агрегатного состояния крови
- Лаборатория физиологически активных веществ
- Лаборатория клеточной биологии и патологии развития
- Лаборатория регуляции репаративных процессов
- Лаборатория когнитивных дисфункций
- Группа клеточного стресса
Руководитель отдела академик А.А. Кубатиев –создатель школы молекулярных и клеточных патофизиологов, в которой подготовлено 10 докторов и 24 кандидата наук. Двое его учеников избраны членами РАН. Автор и соавтор более 460 научных работ, 14 изобретений и патентов, 270 журнальных статей (50 в англоязычных изданиях), 5 монографий. Академик А.А. Кубатиев заведует кафедрой общей патологии и патофизиологии РМАПО. А.А. Кубатиев занимался разработкой фундаментальных механизмов трансформации нормальных клеток в опухолевые, доказал существенную патогенетическую роль нарушений биосинтеза тетраперрольных соединений в генезе развития кроличьей аденокарциномы Брауна-Пирс. Позже разработал и запатентовал оригинальную экспериментальную модель иммунологического тромбоза легочных сосудов, описал все стадии и особенности формирования тромботического процесса в сосудах малого круга кровообращения, выявил неизвестные ранее молекулярные и клеточные механизмы развития артериальных и венозных тромбозов, предложил классификацию неатероматозных артериальных тромбозов, участвовал в создании первого отечественного тромболитического препарата грибкового происхождения (террилитина).
Он обосновал и возглавил разработку в стране нового научного направления — нанопатологии, изучающей нарушения структурно-функциональных свойств, поведения и взаимодействия наночастиц различной природы в организме человека и животных.
В последние годы по инициативе А.А. Кубатиева в институте были развернуты фундаментальные исследования по изучению внутриклеточной регенерации мозга после его ишемических повреждений. Эти работы завершились открытием нового биологического феномена — нейрон-специфического репрограммирования олигодендроцитов и вошли в престижное зарубежное издание «Global Medical Discovery» (2013).