Лаборатория молекулярно-генетического моделирования инфламейджинга

Лаборатория молекулярно-генетического моделирования инфламейджинга

Заведующий лабораторией — к.б.н. Сухоруков Василий Николаевич

vnsukhorukov@gmail.ru

Из истории лаборатории. Лаборатория была организована в декабре 2023 года в процессе разделения лаборатории ангиопатологии по инициативе и предложению директора института член-корр. РАН Морозова Сергея Георгиевича. Лабораторию молекулярно-генетического моделирования инфламейджинга пополнили сотрудники лаборатории ангиопатологии, которые непосредственно были вовлечены в работы, связанные с молекулярно-генетическими аспектами хронического воспаления, которые проявляются с возрастом.

Основные направления деятельности.

Генетические исследования: выявление генов, которые способствуют хронизации воспаления.

Характеристика иммунной системы: изучение роли иммунной системы в старении, в частности, как изменения в функции иммунных клеток, хроническая инфекция низкой степени тяжести и аутоиммунитет способствуют воспалению.

Вычислительное моделирование и биоинформатика: использование вычислительных моделей для понимания сложных взаимодействий, участвующих в воспалении. Это предполагает интеграцию данных геномики, протеомики и метаболомики для моделирования молекулярных сетей, вызывающих воспаление.

Открытие лекарств и терапевтические вмешательства: выявление и тестирование соединений, которые могут модулировать пути, участвующие в воспалении.

Модели на животных и исследования in vivo: использование моделей на животных для изучения причин и последствий воспаления и проверки потенциальных вмешательств.

Разработка клинических биомаркеров: выявление биомаркеров воспаления, которые можно использовать в клинических условиях для оценки риска и мониторинга прогрессирования возрастных заболеваний.

Коллектив лаборатории в своих исследованиях сотрудничает со специалистами из ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии имени академика Е. И. Чазова», а также с другими научно-исследовательскими институтами в России и зарубежом (Франция, Китай, Иран).

Руководитель лаборатории.

Руководитель лаборатории к.б.н. Сухоруков В.Н. является автором и соавтором более 150 научных работ, опубликованных в международных научных журналах. Его h-индекс равен 23.

Сухоруков В.Н. обладает рядом научных наград от научных обществ по изучению атеросклероза:

2018 Young Investigator Award, 11th APSAVD Congress, Iloilo

2019 Young Investigator Award, 12th APSAVD Congress, Taipei

2022 Outstanding Moderated Poster Presentation Award, ICoLA, Seoul

Сухоруков В.Н. активно привлекается международными научными журналами в качестве редактора:

— Current Pharmaceutical Design 2019-2021;

— Frontiers in Cardiovascular Medicine — Atherosclerosis and Vascular Medicine 2021-2023;

— Life (MDPI) 2021-2022;

— International journal of molecular science (MDPI) 2022-2024

— Current Medicinal Chemistry 2023-2024

Основные публикации 2024-2025

  1. Dabravolski SA, Bukrinsky MI, Utkina AS, Ravani AL, Sukhorukov VN, Orekhov AN. Exploring Neutrophil Extracellular Traps in Cardiovascular Pathologies: The Impact of Lipid Profiles, PAD4, and Radiation. 2025;49(6):931-959. doi: 10.32604/biocell.2025.062789. Epub 2025 Jun 24. PMID: 40786884; PMCID: PMC12333638.
  2. Poznyak AV, Orekhov NA, Churov AV, Starodubtseva IA, Kovyanova TI, Pecherina TB, Sukhorukov VN, Orekhov AN. Connection Between Mitochondria and Rheumatoid Arthritis and Osteoarthritis: Personalized Treatment Strategies. Curr Pharm Des. 2025 Apr 30. doi: 10.2174/0113816128354572250408165158. Epub ahead of print. PMID: 40325537.
  3. Blagov A, Bukrinsky M, Utkina A, Babayeva G, Sukhorukov V, Orekhov A. Eosinophils in Rheumatoid Arthritis: A Multifaceted Role in the Pathogenesis of the Disease. Biocell. 2025;49(7):1135-1140. doi: 10.32604/biocell.2025.062821. Epub 2025 Jul 25. PMID: 40786589; PMCID: PMC12333626.
  4. Arabi SM, Rahnama I, Malek-Ahmadi M, Chambari M, Bahrami LS, Milkarizi N, Hatami A, Sukhorukov VN, Sahebkar A. The impact of nut consumption on vascular endothelial function: a GRADE-assessed systematic review and meta-analysis of data from randomised controlled trials. Int J Food Sci Nutr. 2025 Jun;76(4):381-393. doi: 10.1080/09637486.2025.2499045. Epub 2025 May 6. PMID: 40329520.
  5. Blagov AV, Orekhov NA, Beloyartsev DF, Churov AV, Kovyanova TI, Starodubtseva IA, Sukhorukov VN, Orekhov AN. Analysis of the prospects of new therapeutic agents for the treatment of rheumatoid arthritis. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand). 2025 Jul 30;71(7):8-15. doi: 10.14715/cmb/2025.71.7.2. PMID: 40736299.
  6. Poznyak AV, Orekhov NA, Churov AV, Starodubtseva IA, Beloyartsev DF, Kovyanova TI, Sukhorukov VN, Orekhov AN. Interplay of rheumatoid arthritis and cardiovascular disease: Insights and prospects. SAGE Open Med. 2025 Jul 23;13:20503121251330171. doi: 10.1177/20503121251330171. PMID: 40718057; PMCID: PMC12290359.
  7. Dabravolski SA, Churov AV, Ravani AL, Karimova AE, Luchinkin IG, Sukhorukov VN, Orekhov AN. The role of Epsins in atherosclerosis: From molecular mechanisms to therapeutic applications. Vascul Pharmacol. 2025 Mar;158:107457. doi: 10.1016/j.vph.2024.107457. Epub 2024 Dec 11. PMID: 39672315.
  8. Borisov EE, Summerhill VI, Khotina VA, Kosyreva AM, Kovyanova TI, Sukhorukov VN, Orekhov AN. Cells with Defective Mitophagy Do Not Accumulate Atherogenic LDL-Derived Cholesterol. Curr Med Chem. 2025 Feb 27. doi: 10.2174/0109298673294632250108102414. Epub ahead of print. PMID: 40017249.
  9. Blagov A, Orekhov N, Churov A, Starodubtseva I, Beloyartsev D, Kovyanova T, Sukhorukov V, Orekhov A. Current use and development of monoclonal antibodies for the treatment of systemic lupus erythematosus: a review. Antib Ther. 2024 Dec 26;8(1):47-55. doi: 10.1093/abt/tbae033. PMID: 39958566; PMCID: PMC11826920. Q1
  10. Keshavarz Shahbaz S, Koushki K, Izadi O, Penson PE, Sukhorukov VN, Kesharwani P, Sahebkar A. Advancements in curcumin-loaded PLGA nanoparticle delivery systems: progressive strategies in cancer therapy. J Drug Target. 2024 Dec;32(10):1207-1232. doi: 10.1080/1061186X.2024.2389892. Epub 2024 Aug 12. PMID: 39106154. Q1
  11. Jamialahamdi T, Mirhadi E, Almahmeed W, Sukhorukov VN, Eid AH, Salehabadi S, Sahebkar A. The Effect of Bariatric Surgery on PAI-1 Levels: A Systematic Review and Meta-analysis. Obes Surg. 2024 Oct;34(10):3876-3887. doi: 10.1007/s11695-024-07473-1. Epub 2024 Sep 2. PMID: 39222193. Scopus, Q1
  12. Sukhorukov VN, Orekhov AN. Molecular Aspects of Inflammation and Lipid Metabolism in Health and Disease: The Role of the Mitochondria. Int J Mol Sci. 2024 Jun 7;25(12):6299. doi: 10.3390/ijms25126299. PMID: 38928004; PMCID: PMC11204260. Scopus, Q1
  13. Khotina VA, Vinokurov AY, Sinyov VV, Zhuravlev AD, Popov DY, Sukhorukov VN, Sobenin IA, Orekhov AN. Mitochondrial Dysfunction Associated with mtDNA Mutation: Mitochondrial Genome Editing in Atherosclerosis Research. Curr Med Chem. 2024 Oct 11. doi: 10.2174/0109298673323639240926095549. Epub ahead of print. PMID: 39400015. Scopus, Q2
  14. Sukhorukov VN, Khotina VA, Kalmykov VA, Zhuravlev AD, Sinyov VV, Popov DY, Vinokurov AY, Sobenin IA, Orekhov AN. Mitochondrial Genome Editing: Exploring the Possible Relationship of the Atherosclerosis-Associated Mutation m.15059G>A With Defective Mitophagy. J Lipid Atheroscler. 2024 May;13(2):166-183. doi: 10.12997/jla.2024.13.2.166. Epub 2024 Apr 18. PMID: 38826184; PMCID: PMC11140244. Scopus, Q1
  15. Barkas F, Sener YZ, Golforoush PA, Kheirkhah A, Rodriguez-Sanchez E, Novak J, Apellaniz-Ruiz M, Akyea RK, Bianconi V, Ceasovschih A, Chee YJ, Cherska M, Chora JR, D’Oria M, Demikhova N, Kocyigit Burunkaya D, Rimbert A, Macchi C, Rathod K, Roth L, Sukhorukov V, Stoica S, Scicali R, Storozhenko T, Uzokov J, Lupo MG, van der Vorst EPC, Porsch F. Advancements in risk stratification and management strategies in primary cardiovascular prevention. Atherosclerosis. 2024 May 15;395:117579. doi: 10.1016/j.atherosclerosis.2024.117579. Epub ahead of print. PMID: 38824844. Scopus, Q1
  16. Blagov A, Nedosugova L, Kirichenko T, Sukhorukov V, Melnichenko A, Orekhov A. Mitochondrial Dysfunction as a Factor of Energy Metabolism Disorders in Type 2 Diabetes Mellitus. Front Biosci (Schol Ed). 2024 Mar 8;16(1):5. doi: 10.31083/j.fbs1601005. PMID: 38538341. Scopus
  17. Dabravolski SA, Orekhov NA, Glanz VY, Sukhorukov VN, Pleshko EM, Orekhov AN. Role of ABCA1 in Atherosclerosis: Novel Mutations and Potential Plant-derived Therapies. Curr Med Chem. 2024 Mar 25. doi: 10.2174/0109298673291917240315113845. Epub ahead of print. PMID: 38529605. Scopus, Q1
  18. Farhoudi L, Maryam Hosseinikhah S, Vahdat-Lasemi F, Sukhorukov VN, Kesharwani P, Sahebkar A. Polymeric micelles paving the Way: Recent breakthroughs in camptothecin delivery for enhanced chemotherapy. Int J Pharm. 2024 Jun 25;659:124292. doi: 10.1016/j.ijpharm.2024.124292. Epub 2024 May 30. PMID: 38823466. Scopus, Q1
  19. Dabravolski S, Sukhorukov VN, Glanz V, Pleshko E, Orekhov N, Sobenin I. Exosomes in Atherosclerosis: Role in the Pathogenesis and Targets for Therapy. Curr Med Chem. 2024 May 3. doi: 10.2174/0109298673302220240430173404. Epub ahead of print. PMID: 38706365. Scopus, Q1
  20. Khademi Z, Mahmoudi Z, Sukhorukov VN, Jamialahmadi T, Sahebkar A. CRISPR/Cas9 Technology: A Novel Approach to Obesity Research. Curr Pharm Des. 2024 May 30. doi: 10.2174/0113816128301465240517065848. Epub ahead of print. PMID: 38818919. Scopus, Q1
  21. Blagov AV, Summerhill VI, Sukhorukov VN, Zhigmitova EB, Postnov AY, Orekhov AN. Potential use of antioxidants for the treatment of chronic inflammatory diseases. Front Pharmacol. 2024 May 16;15:1378335. doi: 10.3389/fphar.2024.1378335. PMID: 38818374; PMCID: PMC11137403. Scopus, Q1
  22. Blagov AV, Orekhova VA, Sukhorukov VN, Postnov AY, Sobenin IA, Orekhov AN. Influence of antibiotics on the development of mitochondrial dysfunction. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand). 2024 May 27;70(5):170-177. doi: 10.14715/cmb/2024.70.5.24. PMID: 38814220. Scopus, Q4
  23. Khayatan D, Razavi SM, Arab ZN, Khanahmadi M, Samanian A, Momtaz S, Sukhorukov VN, Jamialahmadi T, Abdolghaffari AH, Barreto GE, Sahebkar A. Protective Effects of Plant-Derived Compounds Against Traumatic Brain Injury. Mol Neurobiol. 2024 Mar 1. doi: 10.1007/s12035-024-04030-w. Epub ahead of print. PMID: 38427213. Scopus, Q1
  24. Sukhorukov VN, Khotina VA, Borodko DD, Ekta MB, Oishi Y, Omelchenko AV, Kolmychkova KI, Nikiforov NG, Sobenin IA, Orekhov AN. Evidence for the Involvement of Gene Regulation of Inflammatory Molecules in the Accumulation of Intracellular Cholesterol: The Mechanism of Foam Cell Formation in Atherosclerosis. Curr Med Chem. 2025;32(9):1755-1769. doi: 10.2174/0109298673286400240206095814. PMID: 38415442. Scopus, Q1
  25. Razavi SM, Arab ZN, Niknejad A, Hosseini Y, Fouladi A, Khales SD, Shahali M, Momtaz S, Butler AE, Sukhorukov VN, Jamialahmadi T, Abdolghaffari AH, Sahebkar A. Therapeutic effects of anti-diabetic drugs on traumatic brain injury. Diabetes Metab Syndr. 2024 Jan 26;18(2):102949. doi: 10.1016/j.dsx.2024.102949. Epub ahead of print. PMID: 38308863. Scopus, Q1